熒光定量PCR主要由樣品載台、基因擴增熱循環組件、微量熒光檢測光學係統、微電路控製係統、計算機及應用軟件組成。其中基因擴增熱循環組件工作原理與傳統基因擴增儀大致相同，不同廠家不同型號的產品分別采用空氣加熱、壓縮機製冷、半導體加熱製冷等工作方式。微量熒光檢測係統由熒光激發光學部件、微量熒光檢測部件、光路、控製係統組成。
 

　　熒光定量PCR是指在PCR擴增反應體係中加入熒光基團，通過對擴增反應中每一個循環產物熒光信號的實時檢測,最後通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。具有靈敏度高，特異性強，能實現多重反應，據實時性和準確性等特點，廣泛應用於分子生物學研究和醫學研究等領域。
 

　　PCR板有透明和乳白色可選，其中乳白色更適合用於頂部采集熒光信號的新型熒光定量PCR，但如果熒光定量PCR儀是底部光源的，則應選擇透明的。
 

　　PCR板根據裙邊設計又可分為無裙邊、半裙邊和全裙邊三種設計模式，不同廠家的熒光定量PCR會設計不同的切角或邊緣凸起，請選擇適合該PCR儀的板子。
 

　　PCR板又分100ul體積(矮板)和200ul體積(高板)，根據機型的不同選擇，選擇不同高度孔板，避免高度錯誤對機器造成破壞和加熱不均導致數據失真。
 

　　當使用96孔板做熒光定量PCR實驗的時候，推薦使用光學膜代來密封反應孔。正確的封膜方法是：先沿著96孔板的縱向壓膜，然後橫向，最後沿著板的邊緣按壓使之密封。
 

　　加樣後會在管壁上飛濺一些小液滴，另外反應體係內也會有一些氣泡，需要離心去掉掛壁液滴和氣泡。請使用專用的微孔板離心機解決上述問題。
 

　　PCR板屬於一次性消耗品，生產一次成型，不建議剪開使用容易造成實驗誤差增加，不能清洗或部分重複利用。不要為了節省一點小錢，而給實驗帶來後續分析上的困擾。